Где лежат настройки плагина ToDoList?

Файл имеет расширение .tlbplugin название может быть разным, в зависимости от того, как вы его называли. Лежит файл в папке панели. По умолчанию это:
C:\Users\<имя пользователя>\AppData\Roaming\Microsoft\Internet Explorer\Quick Launch

Для восстановления плугина, просто скопируйте или перенесите файл на панель TLB.

Замечу, что это работает почти со всеми плугинами. Но например для Clipboard Manager вам так же нужно восстановить папку C:\Users\<имя пользователя>\AppData\Roaming\Tordex\True Launch Bar\Clipboard Manager. Если есть возможность то, можно и все эти папки восстановить, чобы получить ту же панель которая была.