Проблема с прозрачным меню.

Но это контекстное меню не позволяет попасть в настройки самого меню, где эти плагины находятся.

Вы сменили шаблон контекстного меню для плугинов - там обрезаны некоторые элементы. Выход либо сменить шаблон на другой в Настройки TLB->Контекстное меню. Либо зажимать CTRL+SHIFT и делать правый клик по плугину, чтобы полное меню показать.

Еще... Никак не могу сделать, чтобы календарь с калькулятором на рабочем столе постоянно висели. После презагрузки пропадают...

Правой кнопкой мыши на кнопку, которая открывает меню Внешний вид->Загружать при старте. И оно будет загружаться при перезагрузке.

Когда открываю снова, они оказываются поверх всех окон, хотя галка в настройках не стоит... Если обновить меню, то они уже оказываются внизу. Вобщем странно ведут себя...

Всегда поверх всех окон? Меню действительно открывается сверху, но может быть перекрыто. Это так?